L'aromathérapeute se distingue du phytothérapeute dans la mesure où il se spécialise dans l'utilisation des huiles essentielles extraites des plantes, et non de tous les éléments des plantes. Il maîtrise les propriétés et spécificités des huiles essentielles sur la santé. Un novice peut en effet ne pas trouver sa voie parmi les différentes variétés d'huiles essentielles de lavande (fine, vraie, aspic) ou d'eucalyptus (radiata, globulus). Le spécialiste de l'aromathérapie guide précisément les clients vers les huiles essentielles et les synergies les mieux adaptées à leurs problèmes de santé. De plus, il possède de bonnes connaissances en biochimie et sur le corps humain. Contrairement à l'aromatologue, l'aromathérapeute ne donne pas de conseils dans les domaines du bien-être ou de la beauté, mais aide à soulager les maux du quotidien : stress, maux de tête, fatigue, problèmes de peau, douleurs articulaires. ou musculaire, la digestion…

Il enseigne à ses clients comment utiliser les huiles essentielles en toute sécurité et les diluer dans des huiles végétales adaptées. Les huiles essentielles sont en effet très concentrées et peuvent avoir des effets puissants à petites doses. Certaines, comme les huiles essentielles d'origan, de ciste ou de sarriette, peuvent même devenir toxiques si elles sont trop utilisées. Le mode d'utilisation est également important car toutes les huiles essentielles ne peuvent pas être utilisées de la même manière : certaines sont déconseillées en diffusion tandis que d'autres le sont par voie topique, par exemple.

En pratique, il faut distinguer entre un conseiller en aromathérapie et un médecin aromathérapeute : le premier ne peut prodiguer que des conseils en aromathérapie tandis que le second a le droit de soigner aux huiles essentielles.