Un examen ou analyse bactériologique permet de trouver et d'identifier les bactéries impliqué dans un infection.

Selon le site d'infection, plusieurs analyses sont possibles :

• examen bactériologique de urine ou ECBU
• examen bactériologique de dans ce (voir culture tige)
• examen bactériologique de sécrétions cervico-vaginales chez les femmes
• examen bactériologique de sperme chez l'homme
• examen bactériologique de sécrétions bronchiques ou crachats
• examen bactériologique de prélèvements de gorge
• examen bactériologique de plaies cutanées
• examen bactériologique de liquide cérébro-spinal (voir ponction lombaire)
• examen bactériologique de sang (voir hémoculture)

Ce type d'examen n'est pas systématiquement prescrit en cas d'infection. Le plus souvent, face à une infection d'origine bactérienne, le médecin prescrit des antibiotiques de manière empirique, c'est-à-dire « au hasard », ce qui est suffisant dans la majorité des cas.

Cependant, plusieurs situations peuvent nécessiter un prélèvement et une analyse bactériologique précise :

• infection chez une personne immunodéprimée
• infection qui ne guérit pas avec les antibiotiques (et donc probablement résistante aux premiers antibiotiques administrés)
• infection nosocomiale (survenant à l'hôpital)
• infection potentiellement grave
• intoxication alimentaire collective
• doute sur la nature virale ou bactérienne de l'infection (par exemple en cas d'angine ou de pharyngite)
• diagnostic de certaines infections comme la tuberculose
• et ainsi de suite