A coproculture est une examen des selles qui consiste à rechercher le présence de bactéries. Il permet de trouver le cause de diarrhée bactérienne aiguë et mieux cibler le traitement antibiotique.

Un examen parasitologique des selles peut également être fait pour vérifier la présence de parasites.

La coproculture est prescrit pour les diarrhées aiguës évocatrices de infection bactérienne, en cas de :

• au moins trois selles molles ou liquides par jour pendant plus de 24 heures et moins de 14 jours
• fièvre supérieure ou égale à 40°C,
• présence de mucus ou de sang dans les selles,
• douleur abdominale,
• retour d'un voyage dans un pays où les diarrhées bactériennes sont fréquentes (zone d'endémie)
• diarrhée survenant chez un patient hospitalisé (risque de diarrhée nosocomiale à Clostridium difficile)
• toxine-infection alimentaire collective (TIAC)

Il ne faut cependant pas oublier que la plupart des gastro-entérites aiguës sont d'origine virale ; les rotavirus étant responsables de plus de 50 % des cas, notamment chez les nourrissons. La culture des selles n'a aucun intérêt dans ces cas.

En cas de diarrhée chronique, la coproculture est également inutile.

L'examen consiste à prélever un petit échantillon (environ 10 à 20 g) de selles.

Les procédures peuvent différer selon les laboratoires d'analyses, et le prélèvement peut être effectué sur place ou à domicile. Le plus souvent, le patient est muni d'un récipient stérile et d'une petite spatule pour le prélèvement. La selle doit être délivrée sur un sac poubelle propre placé sur la cuvette des toilettes ou dans un bassin spécial. Des gants sont généralement fournis : il suffit alors d'en prélever une petite quantité, de l'insérer dans le(s) pot(s) prévu(s) et d'évacuer le reste des selles dans les toilettes.

L'échantillon doit être conservé au réfrigérateur et apporté au laboratoire le plus rapidement possible (s'il n'est pas prélevé sur place).

Chez les nourrissons ou les enfants, les selles sont recueillies à l'aide d'un écouvillon.

Au laboratoire, les selles seront analysées (cultivées) à la recherche d'une dizaine de bactéries responsables de diarrhées infectieuses, dont salmonelle (des salmonelles), Shigella, Campylobacter, etc.

Notez que Salmonella est la cause la plus fréquente de diarrhée bactérienne aiguë d'origine alimentaire. En fonction du résultat, le médecin vous proposera un traitement adapté.

La coproculture n'est positive que dans 0,5 à 14% des cas, car de nombreuses diarrhées sont virales mais aussi parce que l'examen n'est pas toujours facile à réaliser et à interpréter.