Face à des signes pouvant évoquer un reflux, le médecin peut poser ce qu'on appelle un diagnostic « présomptif ». Il pense que cette personne souffre probablement de reflux (sans aucune certitude). Compte tenu de la fréquence des reflux gastro-œsophagiens, cette présomption autorise le médecin à prescrire un « traitement test » par médicaments, et les consignes diététiques hygiéniques, ci-après citées.

Si les symptômes ne s'améliorent pas avec le traitement, cela peut être autre chose que le reflux. Il est donc important de consulter un gastro-entérologue sur avis du médecin traitant, pour la réalisation d'une « endoscopie haute » ou « » Fibroscopie »Après l'arrêt du traitement.

Cela vous permet de voir la muqueuse de l'œsophage et de l'estomac et, si nécessaire, de prélever des échantillons. Le spécialiste détecte ainsi parfois une « œsophagite à éosinophiles », une inflammation de l'œsophage liée non pas à un reflux, mais à une infiltration de globules blancs spécifiques. De même, cet examen permet de détecter rapidement, en voyant chez eux une « œsophagite peptique, une sténose, un cancer ou une endobrachie de l'œsophage ».

Souvent la fibroscopie est normale, et ne confirme pas le « reflux »

Le reflux gastro-œsophagien pathologique sera authentifié par un test appelé pHmétrie qui quantifie l'existence ou non d'un reflux sur 24 heures en mesurant le degré d'acidité de l'œsophage. Ce test consiste à insérer une sonde par le nez dans l'œsophage. Sur la sonde, des capteurs collectent le pH de l'œsophage et différencient le reflux pathologique du normal. Elle doit être réalisée 7 jours après la prise de tout médicament de type inhibiteur de la pompe à protons (IPP) afin que les résultats ne soient pas perturbés par les médicaments.

Si les symptômes persistent chez une personne ayant des antécédents d'œsophagite ou une mesure de pH positive sans traitement, un « PH-impédancemétrie » sous traitement peuvent être proposés, ce qui permet de différencier les reflux liquides, gazeux, acides ou non acides.

Enfin, par souci d'exhaustivité, on peut essayer de détecter les troubles moteurs de la conduction œsophagienne par la pratique d'un TOGD : transit oeso gastro duodénal. Il permet de visualiser les contours de l'œsophage et ses mouvements après ingestion d'un produit radio-opaque. Il peut détecter les contours d'une hernie hiatale.

D'autres examens, le manométrie et la « manométrie haute résolution » permettent d'analyser, par des capteurs intra-œsophagiens, la motricité de l'œsophage.

Certaines personnes présentent un trouble fonctionnel, une hypersensibilité viscérale (la muqueuse de leur œsophage est sensible) : on constate qu'elles ont une endoscopie normale, une exposition acide normale (pHmétrie), un nombre total de reflux physiologique, normal, mais une concordance entre les symptômes et le reflux sous impédancemétrie.