Les symptômes dépendent de la forme de la leishmaniose. Souvent, la morsure passe inaperçue.

• Leishmaniose cutanée : la forme cutanée se manifeste par une ou plusieurs papules rouges indolores (petits boutons saillants), incrustées dans la peau, puis ulcérées, puis et se recouvrant d'une croûte, laissant place après des mois d'évolution à une cicatrice indélébile. Si le visage est le premier touché (d'où le nom de « bouton oriental »), la forme cutanée peut également toucher toutes les autres zones de peau découvertes.
• Leishmaniose viscérale : si la forme cutanée est facilement identifiable, il n'en est pas toujours de même pour la forme viscérale qui peut passer inaperçue. Les porteurs dits « asymptomatiques » (sans aucun signe observable) sont donc fréquents. Lorsqu'elle se manifeste, la forme viscérale se manifeste tout d'abord par une fièvre de 37,8-38,5 pendant deux à trois semaines, par une altération de l'état général, pâleur, amaigrissement et fatigue, fièvre oscillante, difficultés respiratoires (par manque de globules rouges), troubles du caractère, nausées et vomissements, diarrhée, ainsi qu'une augmentation de la taille du foie (hépatomégalie) et de la rate (splénomégalie), d'où le nom de leishmaniose viscérale. Une palpation minutieuse trouve de petits ganglions lymphatiques disséminés (adénopathies). Enfin, la peau peut prendre un aspect gris terreux, d'où le nom « kala-azar » qui signifie « mort noire » en sanskrit.
• Leishmaniose muqueuse : la leishmaniose se manifeste par des lésions nasales et buccales (lésions infiltrées, perforation de la cloison nasale, etc.), progressivement destructrices avec un risque vital en l'absence de traitement.