Les symptômes de la leptospirose apparaissent entre 4 jours et 2 à 3 semaines après le contact avec l'infection. Le plus souvent, ils ressemblent à une grippe avec :

– fièvre (généralement supérieure à 39°C),

- des frissons,

- maux de tête,

– douleurs musculaires, articulaires, abdominales.

– des saignements peuvent également survenir.

Dans les formes les plus graves, il peut apparaître, dans les jours suivants :

– la jaunisse caractérisée par une coloration jaune de la peau et du blanc des yeux,

– insuffisance rénale,

- insuffisance hépatique,

– atteinte pulmonaire,

– une infection cérébrale (méningite),

– troubles neurologiques (convulsions, coma).

Contrairement aux formes sévères, il existe également des formes d'infection sans aucun symptôme.

Si la récupération est longue, il n'y a généralement pas de séquelles en dehors de la possibilité de complications oculaires tardives. Cependant, dans les formes sévères, non traitées ou traitées avec retard, la mortalité dépasse 10 %.

Dans tous les cas, le diagnostic repose sur des signes et symptômes cliniques, des analyses de sang, voire l'isolement de la bactérie dans certains prélèvements.

Au tout début de l'infection, seule la détection de l'ADN, c'est-à-dire du matériel génétique de la bactérie dans le sang ou d'autres fluides corporels, permet de poser un diagnostic. La recherche d'anticorps contre la leptospirose reste le test le plus utilisé, mais ce test n'est positif qu'au bout d'une semaine, le temps que l'organisme fabrique des anticorps contre cette bactérie et qu'ils peuvent être en quantité. suffisant pour être dosable. Il peut donc être nécessaire de refaire ce test s'il est négatif car réalisé trop tôt. De plus, la confirmation formelle de l'infection doit être faite par une technique particulière (test de microagglutination ou MAT) qui, en France, n'est réalisée que par le centre national de référence de la leptospirose.